핵자기 공명 분광기 (Nuclear Magnetic Resonance:NMR)은  물리,화학,생물학과 등 여러분야에서 물질의 구조 및 특성을 연구하기 위해 핵자기 공명 현상을 이용하는 것이다.핵자기 공명현상이란 원자핵에 자기장을 걸면 무질서하게 흩어져 있던 핵들이 몇 가지 에너지 상태로 배열하며 이들 각 상태의 에너지 차이에 해당되는 만큼 전자기파를 흡수하여 낮은 데서 높은 에너지 상태로 옮겨가는 것을 말한다.이 때 에너지를 흡수한 원자핵들은 특정 주파수의 신호를 만들어서 분자의 국소구조(local structure)에 대한 정보를 제공하며 이렇게 얻어진 국소 구조의 정보를 바탕으로 하여 전체적인 분자구조를 결정하게 된다.NMR 분광법은 일반적으로 일차원(1D)에서 화학적 구조를 연구할 수 있으며 이차원(2D)에서 좀 더 복잡한 분자구조를 결정할 수 있다.

 참고로 300MHz란 1초에 3억번 진동하는 전자기파를 뜻하는데, NMR에서는 수소핵의 공명주파수가 300MHz에 해당되는 자기자의 세기를 나타내는 말로서 약 7.05 T(tesla, 1T=1000 Gauss) 정도이다.

 또한 물질의 구조를 결정하기 위해 NMR과 더불어 사용하는 것이 질량분석기(Mass Spectrometer)이다.질량 분석기는 물질의 분자량 즉 질량을 확인하는 분석장비이다.분자는 고에너지를 가지는 전자와 충돌을 하면 이온화(ionization)될 수 있다는 원리에 착안하여 고안된 기기로 이 과정을 통해 전하를 띤 토막이온들(charged fragments)은 질량분석관을 통과하면서 고유의 질량수로 나타나게 된다.질량 분석기는 이온화원(ionization source)과 이완화된 시료를 질량 대 전하 비(m/z)에 따라 분리하는 질량분석관에 따라 다양하게 나눌 수 있다.전기분부 이온화법(Electro-Spray Ionization:ESI)은 유기물이나 단백질 시료를 이온화시키는 가장 대표적인 방법으로 액체상의 시료를 다양한 분석장비(LC,GC 등)와 직접 연결하여 사용하기도 한다.본 기기는 질량분석관으로 비행시간형(Time Of Flight:TOF)이며 이온화방법으로는 ESI 방법을 이용하고 액체크로마토그래피(LC)와 연결된 분석장비이다.